池田 大介
准教授
池田 大介
Daisuke
Ikeda

主な研究テーマ

トラフグやメダカ、ゼブラフィッシュ、さらにはシーラカンスやヤツメウナギ、ニホンウナギなど、様々な魚類のゲノム情報が既に解読・公開されている。本研究では公開されている魚類のゲノム情報を積極的に利用しつつ、次世代シークエンサーやゲノム編集等の先端機器・技術を活用し、ミオシン重鎖を中心とした筋肉を構成するタンパク質の性状、生理的意義さらには分子進化や転写調節機構の解明を目指す。

具体的テーマ

(1) 魚類の筋発生、筋再生および筋分化に関する研究
(2)ミオシン重鎖の分子進化に関する研究
(3)小型魚類を活用した筋萎縮に関する研究
  -運動しなくても筋肉が落ちない体を作るためには?-
(4) 外来遺伝子導入・ゲノム編集技術を用いた魚類筋および脂肪細胞の作出
  -ニホンウナギ線維芽細胞から培養肉が作れる?-
(5)魚肉練り製品に最適なミオシン重鎖とは何か
  -遺伝子配列から好適原料を探る-
緑色蛍光タンパク質と転写因子の融合タンパク質を発現させた魚類線維芽細胞緑色蛍光タンパク質と転写因子の融合タンパク質を発現させた魚類線維芽細胞。
市販のそうめん流し機を小型魚類の強制遊泳装置として流用市販のそうめん流し機を小型魚類の強制遊泳装置として流用。

担当科目

1年次生対象

2年次生対象生化学
3年次生対象海洋生命科学実験III、科学英語IIB
4年次生対象

その他

経歴・業績等

主な経歴

  • 東京水産大学水産学部卒業
  • 東洋水産株式会社 第二研究開発部
  • 東京大学大学院農学生命科学研究科博士課程修了
  • University of Massachusetts Medical School 博士研究員
  • 東京大学大学院農学生命科学研究科 特任助教
  • 北里大学海洋生命科学部 准教授

主な業績

著書
  • Shugo Watabe, Hideki Ushio, Daisuke Ikeda, Radiocesium Contamination of Marine Fish Muscle and Its Effective Elimination. In: Tomoko M. Nakanishi and Keitaro Tanoi (eds) Agricultural Implications of the Fukushima Nuclear Accident. Springer, Tokyo, 97-103 (2013).
  • 池田大介、渡部終五: トラフグの全ゲノム解析はなぜ行われたか-データベースの値打ちと魚類ゲノム科学の新展開. 海洋生命系のダイナミクス・シリーズ 第2巻 海洋生物の機能 生命は海にどう適応しているか (竹井祥郎編) 東海大学出版会 秦野, pp.160-182 (2005).
論文
  • Shugo Watabe, Daisuke Ikeda, Takaki Mashiro, Yuko Kagetakubo, Yoshihiro Takahashi, Misaki Uemura, Nanami Mizusawa, Hiroki Koyama, Ko Yasumoto, Mitsuru Jimbo, Nobuhiro Kan-no, Tomohiro Ueda, Yoko Matsuoka, Nobuhiko Ueki & Jianrong Wan Suitability of Japanese codling as a raw material for surimi-based products revealed by primary sequence analysis of myosin heavy chain and thermal gel properties. Fish. Sci. 86, 711–719 (2020). 10.1007/s12562-020-01430-4
  • Yo Okamura, Natsuki Morimoto, Daisuke Ikeda, Nanami Mizusawa, Shugo Watabe, Hiroshi Miyanishi, Yuichi Saeki, Haruko Takeyama, Takashi Aoki, Masato Kinoshita, Tomoya Kono, Masahiro Sakai and Jun-ichi Hikima. Interleukin-17A/F1 Deficiency Reduces Antimicrobial Gene Expression and Contributes to Microbiome Alterations in Intestines of Japanese medaka (Oryzias latipes). Front. Immunol. 11:425 (2020). 10.3389/fimmu.2020.00425.
  • Md. Asaduzzaman, Shumpei Iehata, Md. Moudud Islam, Md. Abdul Kader, Daisuke Ikeda and Shigeharu Kinoshita. Sodium alginate supplementation modulates gut microbiota, health parameters, growth performance and growth-related gene expression in Malaysian Mahseer Tor tambroides. Aquac. Nutr. 25, 1300-1317 (2019). 10.1111/anu.12950
  • Hiroki Koyama, Nanami Mizusawa, Masataka Hoashi, Engkong Tan, Ko Yasumoto, Mitsuru Jimbo, Daisuke Ikeda, Takehiko Yokoyama, Shuichi Asakawa, Sanit Piyapattanakorn and Shugo Watabe: Changes in free amino acid concentrations and associated gene expression profiles in the abdominal muscle of kuruma shrimp Marsupenaeus japonicus acclimated at different salinities. J. Exp. Biol. 221, jeb168997 (2018). 10.1242/jeb.168997.
  • Md. Shaheed Reza, Atsushi Kobiyama, Yuichiro Yamada, Yuri Ikeda, Daisuke Ikeda, Nanami Mizusawa, Kazuho Ikeo, Shigeru Sato, Takehiko Ogata, Mitsuru Jimbo, Toshiaki Kudo, Shinnosuke Kaga, Shiho Watanabe, Kimiaki Naiki, Yoshimasa Kaga, Katsuhiko Mineta, Vladimir Bajic, Takashi Gojobori and Shugo Watabe: Taxonomic profiles in metagenomic analyses of free-living microbial communities in the Ofunato Bay. Gene 665, 192-200 (2018). 10.1016/j.gene.2018.04.075.
  • Daisuke Ikeda, Hiroki Koyama, Nanami Mizusawa, Nobuhiro Kan-no, Engkong Tan, Shuichi Asakawa and Shugo Watabe: Global gene expression analysis of the muscle tissues of medaka acclimated to low and high environmental temperatures. Comp. Biochem. Physiol., Part D 24, 19-28 (2017). 10.1016/j.cbd.2017.07.002.
  • Daisuke Ikeda, Yosuke Ono, Shigeki Hirano, Nobuhiro Kan-no and Shugo Watabe: Lampreys have a single gene cluster for the fast skeletal myosin heavy chain gene family. PLoS One 8, e85500 (2013).
  • Yosuke Ono, Shigeharu Kinoshita, Daisuke Ikeda and Shugo Watabe: Early development of medaka Oryzias latipes muscles as revealed by transgenic approaches using embryonic and larval types of myosin heavy chain genes. Dev. Dyn. 239, 1807–1817 (2010).
  • Daisuke Ikeda, Yoshiaki Nihei, Yosuke Ono and Shugo Watabe: Three embryonic myosin heavy chain genes encoding different motor domain structures from common carp show distinct expression patterns in cranial muscles. Mar. Genomics 3, 1-9 (2010).
  • Daisuke Ikeda, Yosuke Ono, Phil Snell, Yvonne J. K. Edwards, Greg Elgar and Shugo Watabe: Divergent evolution of the myosin heavy chain gene family in fish and tetrapods: evidence from comparative genomic analysis. Physiol. Genomics 32, 1-15 (2007).